-
Копылова В.С., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Применение модели артериальной системы мозга крысы для оценки интегрального распределения концентраций кислорода и глюкозы // Сборник научных трудов VII съезда биофизиков России: в 2 томах. – Краснодар: Типография ФГБОУ ВО «КубГТУ», 2023, т. 1, стр. 336.
-
Бороновский С.Е., Копылова В.С., Нарциссов Я.Р.
Моделирование работы глутамат-цистеин лигазы на основе стохастических методов // Сборник научных трудов VII съезда биофизиков России: в 2 томах. – Краснодар: Типография ФГБОУ ВО «КубГТУ», 2023, т. 1, стр. 307.
-
Копылова В.С., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Оценка интегрального распределения концентраций кислорода и глюкозы на основе модели артериальной системы мозга крысы. // IX Международная конференция молодых ученых: вирусологов, биотехнологов, биофизиков, молекулярных биологов и биоинформатиков — 2022: Cб. тез. / АНО «Иннов. центр Кольцово». — Новосибирск: ИПЦ НГУ, 2022. — 351 стр.
-
Зайцев К.С., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Обратный захват глицина у млекопитающих: моделирование работы переносчика. // VI Съезд биофизиков России. Сборник научных трудов VI съезда биофизиков России: в 2 т. – Краснодар: Полиграфическое объединение «Плехановец», 2019, т. 1, стр. 155-156
-
Титова В.Ю., Бороновский С.Е., Ransac S., Нарциссов Я.Р., Mazat J.P.
Стохастическое моделирование трансмембранного переноса протонов в цитохром с-оксидазе митохондрий. // VI Съезд биофизиков России. Сборник научных трудов VI съезда биофизиков России: в 2 т. – Краснодар: Полиграфическое объединение «Плехановец», 2019, т. 1, стр. 232-233
-
Копылова В.С., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Применение фрактального анализа для оценки оптимальной структуры артериального дерева мозга крысы. // VI Съезд биофизиков России. Сборник научных трудов VI съезда биофизиков России: в 2 т. – Краснодар: Полиграфическое объединение «Плехановец», 2019, т. 1, стр. 351-352
-
Anastasia Garbuz, Stanislav Boronovskiy, Yaroslav Nartsissov.
Predictive modeling of ion localization times in the channel of the 5-HT3 receptor. // Programme and abstracts, ISGSB 2018, Tromsø, P.10
-
Veronika Kopylova, Stanislav Boronovskiy, Yaroslav Nartsissov.
Distribution of the key metabolites in the rat brain tissues using the model of vasculature. // Programme and abstracts, ISGSB 2018, Tromsø, P.9
-
Nikolai Kazmiruk, Stanislav Boronovskiy, Yaroslav Nartsissov.
A computer simulation of the phosphate activated glutaminase localization in the astrocyte mitochondria. // Programme and abstracts, ISGSB 2018, Tromsø, P.8
-
Zagubnaya O. A., Boronovskiy S.E. and Nartsissov Ya.R.
Stochastic modeling of glutamate transporter functioning. // Programme and abstracts, ITTS 2018, Vienna, PP-66
-
Victoria Titova, Stanislav Boronovskiy, Jean-Pierre Mazat, Yaroslav Nartsissov, Stephane Ransac.
The stochastic modelling of proton pumping: the contribution of the K-channel. // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Bioenergetics, 1859, Supplement, 2018, P. e73
-
Kazmiruk, N., Boronovskiy, S., Nartsissov, Y.
Glutamine synthetase from Esherichia coli: a modeling of isotope exchange reactions using a stochastic approach. // FEBS J, 2017, 284: P.3.3.B-025. doi:10.1111/febs.14174
-
Titova, V., Stephane, R., Boronovskiy, S., Mazat, J., Nartsissov, Y.
Influence of cellular factors on oxygen consumption and transmembrane proton transport in cytochrome c oxidase. // FEBS J, 2017, 284: P.3.1.A-015. doi:10.1111/febs.14174
-
Garbuz, A., Boronovskiy, S., Nartsissov, Y.
The prediction of essential donors and acceptors involved in proton transfer through the D-channel of cytochrome c oxidase. // FEBS J, 2017, 284: P.2.1-045. doi:10.1111/febs.14174
-
Kopylova, V., Boronovskiy, S., Nartsissov, Y.
Geometry of the vasculature is the basis for metabolites distribution in different tissues. // FEBS J, 2017, 284: SpT.3.3.B-002. doi:10.1111/febs.14171
-
Копылова В.С., Бороновский С.Е.
Анализ топологии артериального дерева в модели кровеносной системы мозга крысы. Материалы Международного молодежного научного форума «ЛОМОНОСОВ-2017» // Отв. ред. И.А. Алешковский, А.В. Андриянов, Е.А. Антипов. [Электронный ресурс] — М.: МАКС Пресс, 2017.
-
Victoria Titova, Anastasia Garbuz, Stephane Ransac, Stanislav Boronovskiy, Yaroslav Nartsissov, Jean‐Pierre Mazat.
Computer modeling of cytochrome c oxidase H+/e‐ efficiency. // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Bioenergetics, 1857, Supplement, 2016, P. e45
-
Kiril S. Zaytsev, Stanislav E. Boronovsky, Yaroslav Nartsissov.
Synaptic and near synaptic glycine transport – What is the reason to be different? // Programme and abstracts, ISGSB 2016 Jena, 2016, P. 93
-
Yaroslav Nartsissov, S.E. Boronovsky, E.V. Mashkovtseva.
The geometry of a blood vessels bifurcation can affect the level of trophic damages under forming of a brain ischemic lesion. // Programme and abstracts, ISGSB 2016 Jena, 2016, P. 68
-
Veronika Kopylova, Yaroslav Nartsissov, Stanislav Boronovskiy.
Spatial distribution analysis of tree topology in arterial system model. // Programme and abstracts, ISGSB 2016 Jena, 2016, P.55
-
Viktoria Titova, Anastasia Garbuz, Jean‐Pierre Mazat, Stanislav Boronovskiy, Yaroslav Nartsissov, Stephane Ransac.
Computer modeling of cytochrome c oxidase H+/e‐ efficiency. // Programme and abstracts, ISGSB 2016 Jena, 2016, P. 48
-
Stanislav Boronovskii, Anastasia Garbuz, Yaroslav Nartsissov.
Stochastic simulation modeling of proton transport through D–channel in cytochrome c oxidase. // Programme and abstracts, ISGSB 2016 Jena, 2016, P. 113
-
Титова В.Ю., Ransac S., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р., Mazat J.P.
Анализ элементарных путей восстановления кислорода в цитохром c-оксидазе на основе стохастической модели. // V Съезд биофизиков России. Материалы докладов: в 2 т. – Ростов-на-Дону: Издательство Южного федерального университета, 2015, т. 1, стр. 288.
-
Титова В.Ю., Бороновский С.Е., Ransac S., Нарциссов Я.Р., Mazat J.P.
Компьютерный симулятор активности цитохром c-оксидазы млекопитающих. // V Съезд биофизиков России. Материалы докладов: в 2 т. – Ростов-на-Дону: Издательство Южного федерального университета, 2015, т. 1, стр. 121.
-
Машковцева Е.В., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Современный подход к виртуальному моделированию биоэнергетики митохондрий. // V Съезд биофизиков России. Материалы докладов: в 2 т. – Ростов-на-Дону: Издательство Южного федерального университета, 2015, т. 1, стр. 272.
-
Кофанова О.А., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Стохастическое моделирование глутаматного переносчика в нейронах млекопитающих. // V Съезд биофизиков России. Материалы докладов: в 2 т. – Ростов-на-Дону: Издательство Южного федерального университета, 2015, т. 1, стр. 361.
-
Копылова В.С., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р., Crolet J.M.
Компьютерное моделирование топологии кровеносной системы мозга крысы. // V Съезд биофизиков России. Материалы докладов: в 2 т. – Ростов-на-Дону: Издательство Южного федерального университета, 2015, т. 2, стр. 317.
-
Зайцев К.С., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Многокомпонентная регуляция переноса аминокислоты глицин через мембрану нейронов – новые перспективы создания лекарственных препаратов. // V Съезд биофизиков России. Материалы докладов: в 2 т. – Ростов-на-Дону: Издательство Южного федерального университета, 2015, т. 1, стр. 188.
-
Zaytsev Kirill, Boronovskiy Stanislav, Nartsissov Yaroslav.
Computer simulation of glycine reuptake in neurons (GlyT2). // From Cell to Organism, Durham University, 2014, P. 23
-
E.V. Mashkovtseva, S.E. Boronovskiy, Ya.R. Nartsissov.
Description of ATP distribution in mitochondria using theoretical model of FoF1-ATPsynthase. // From Cell to Organism, Durham University, 2014, P. 19
-
Veronika Kopylova, Yaroslav Nartsissov, Stanislav Boronovskiy.
Computer simulation of circulatory system in the rat brain. // From Cell to Organism, Durham University, 2014, P. 19
-
Olga A., Kofanova; Stanislav E., Boronovskiy; Yaroslav R., Nartsissov.
Computational Modelling of Mammalian Neuronal Glutamate Transporter. // From Cell to Organism, Durham University, 2014, P. 19
-
Viktoriia Titova, Yaroslav Nartsissov, Stanislav Boronovskiy.
Evaluation of pumping efficiency of mammalian cytochrome c oxidase. // From Cell to Organism, Durham University, 2014, P. 21.
-
Olga A. Kofanova, Stanislav E. Boronovskiy, Yaroslav R. Nartsissov.
Stochastic modelling of neuronal membrane glutamate transporters. // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Bioenergetics, 1837, Supplement, 2014, P. e110.
-
Elena Mashkovtseva, Stanislav Boronovskiy, Yaroslav Nartsissov.
Evaluation of mitochondrial ATP distribution using theoretical description of FoF1-ATPsynthase catalytic cycle. // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Bioenergetics, 1837, Supplement, 2014, P. e17.
-
Zaytsev Kirill, Boronovskiy Stanislav, Nartsissov Yaroslav.
Stochastic model of glycine transporter and its application to amino acid transport in mammalian neurons. // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Bioenergetics, 1837, Supplement, 2014, P. e109.
-
Yaroslav Nartsissov, Viktoriia Titova, Stanislav Boronovskiy.
A computer simulator of mammalian cytochrome c oxidase activity. // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Bioenergetics, 1837, Supplement, 2014, P. e101.
-
А.В. Харлак, С.Е. Бороновский, Я.Р. Нарциссов.
Моделирование трансмембранного переноса ионов натрия и калия через канал глутаматного рецептора GLUR2. // Научная сессия НИЯУ МИФИ – 2014. Аннотации докладов. – Москва, 2014, т. 1, стр. 107.
-
Н.О. Прасолова, С.Е. Бороновский, Я.Р. Нарциссов.
Моделирование протонного и электронного транспорта в интегральном мембранном белке цитохром с-оксидазе. // Научная сессия НИЯУ МИФИ – 2014. Аннотации докладов. – Москва, 2014, т. 1, стр. 106.
-
В.С. Копылова, С.Е. Бороновский, Я.Р. Нарциссов.
Компьютерное моделирование топологии кровеносной системы в мозге крыс. // Научная сессия НИЯУ МИФИ – 2014. Аннотации докладов. – Москва, 2014, т. 1, стр. 105.
-
Ekaterina S. Tyukina, Elena V. Sheshegova, S.E. Boronovsky, Yaroslav R. Nartsissov.
Application of Mathematical Modeling of Metabolite Diffusion to Quantitative Estimation of Non-steady State Glucose Concentration Gradients in Rat Brain Pial. // NeuroTalk – 2013 – P. 174.
-
Turchenkov D.A., Boronovskiy S.E., Nartsissov Ya.R.
Modeling of ion diffusion in water solutions based on methods of Langevin dynamics. // Abstract book of 15th Workshop of the International Study Group for Systems Biology. 2012. P. 42
-
Zaytsev K.S., Mashkovtseva E.V., Boronovskiy S.E., Nartsissov Ya.R.
Glycine reuptake in mammalian: computer simulation of transporter proteins. // Abstract book of 15th Workshop of the International Study Group for Systems Biology. 2012. P. 87
-
Mashkovtseva E.V., Boronovskiy S.E., Nartsissov Ya.R.
Description of FoF1-ATP synthase catalytic cycle using combined mathematical methods. // Abstract book of 15th Workshop of the International Study Group for Systems Biology. 2012. P. 86
-
Kofanova О.А., Boronovskiy S.E., Nartsissov Ya.R.
Probability analysis of mammalian glutamate transporter functioning. // Abstract book of 15th Workshop of the International Study Group for Systems Biology. 2012. P. 88.
-
Mashkovtseva E.V., Boronovskiy S.E., Nartsissov Ya.R.
Evaluation of neuronal cell energetic status using theoretical description of FoF1-ATPsynthase catalytic cycle. // BBA-Bioenergetics, Vol. 1817, Suppl. 2012, p. S19
-
Кофанова О.А., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Компьютерное моделирование активности мембранного переносчика глутамата в нейронах млекопитающих. // IV Съезд биофизиков России. Симпозиум II «Физические основы физиологических процессов». Материалы докладов. – Нижний Новгород, 2012, т.2, стр. 80
-
Зайцев К.С., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Моделирование транспорта глицина в нейронах млекопитающих. // IV Съезд биофизиков России. Симпозиум II «Физические основы физиологических процессов». Материалы докладов. – Нижний Новгород, 2012, т.2, стр. 55
-
Лизякина А.Д., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Применение стохастического подхода к описанию процессов функционирования различных белковых комплексов. // IV Съезд биофизиков России. Симпозиум I «Физико-химические основы функционирования биополимеров и клеток». Материалы докладов. – Нижний Новгород, 2012, т. 1, стр. 198
-
Турченков Д.А., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Моделирование диффузии ионов в стохастической модели Ланжевена с использованием приближения диэлектрического трения. // IV Съезд биофизиков России. Симпозиум I «Физико-химические основы функционирования биополимеров и клеток». Материалы докладов. – Нижний Новгород, 2012, т. 1, стр. 293
-
Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Применение стохастического подхода и методов броуновской динамики для описания ионных каналов на примере глицинового рецептора. // IV Съезд биофизиков России. Симпозиум II «Физические основы физиологических процессов». Материалы докладов. – Нижний Новгород, 2012, т. 2., стр. 26
-
Машковцева Е.В., Бороновский С.Е., Нарциссов Я.Р.
Оценка биоэнергетического обеспечения нервных клеток с помощью математического моделирования FoF1-АТФсинтазы. // IV Съезд биофизиков России. Симпозиум IV «Новые тенденции и методы в биофизике». Материалы докладов. – Нижний Новгород, 2012, т. 1, стр. 198
-
Д.А. Турченков, С.Е. Бороновский, Я.Р. Нарциссов.
Моделирование диффузии ионов с использованием стохастического интегрирования уравнения Ланжевена. // Научная сессия МИФИ-2012 Сборник научных трудов.- Т.2.- 2012.- С.137.
-
А.Д. Лизякина, С.Е. Бороновский, Я.Р. Нарциссов.
Построение модели трансмембранного переноса метаболитов на примере гамма-аминомасляной кислоты. // Научная сессия МИФИ-2012 Сборник научных трудов.- Т.2.- 2012.- С.136.
-
Boronovsky, S.E. and Nartsissov, Ya.R.
Probability simulator of enzyme activity and its application to description of transmembrane currents through glycine receptor. // In book: Modern Trends in System Biology. Virtual modeling and Regulation, 2010, pp. 113-119.
-
Mashkovtseva, E.V., Boronovsky, S.E. and Nartsissov, Ya.R.
Mechano-probability Model of FoF1-ATPsynthase Catalytic Cycle: A Novel Approach to ATP Synthesis and Hydrolysis Description. // In book: Modern Trends in System Biology. Virtual modeling and Regulation, 2010, pp. 152-155.
-
Zaytsev, K.S., Boronovsky, S.E., Mashkovtseva, E.V. and Nartsissov, Ya.R.
Computer simulation of glycine transport in mammalian neurons. // In book: Modern Trends in System Biology. Virtual modeling and Regulation, 2010, pp. 122-125.
-
Kofanova, O.A., Boronovsky, S.E., Mashkovtseva, E.V. and Nartsissov, Ya.R.
Computer simulation of glutamate transport via EAAT 4 neuron transporter. // In book: Modern Trends in System Biology. Virtual modeling and Regulation, 2010, pp. 120-121.
-
Seraya, I.P., Tyukina, E.S., Boronovsky, S.E. and Nartsissov, Ya.R.
Numerical Estimations of Non-steady State Gradients of Nitric Oxide in Pial Brain Layer Phantoms. What is the Border between Physiology and Toxicity. // 11th International Conference on System Biology, 2010, pp. 120.
-
Zaytsev, K.S., Boronovsky, S.E., Mashkovtseva, E.V. and Nartsissov, Ya.R.
Modeling of Glycine Transport in Mammalian Neurons Using Computer Simulation of GLYT2 Activity. // 11th International Conference on System Biology, 2010, pp. 160.
-
Sheshegova, E.V., Tyukina, E.S., Boronovsky, S.E. and Nartsissov, Ya.R.
Computer Modeling of Spatial-time Distribution of Glucose in: Application to Therapy and Diagnostic of Neurological Diseases. // 11th International Conference on System Biology, 2010, pp. 121.
-
Kofanova, O.A., Boronovsky, S.E., Mashkovtseva, E.V. and Nartsissov, Ya.R.
Computer Modeling of Glutamate Transport using a Virtual Simulator of Purkinje Neuron Transporter. // 11th International Conference on System Biology, 2010, pp. 125.
-
Mashkovtseva, E.V., Boronovsky, S.E. and Nartsissov, Ya.R.
Quantum-mechanical description of step-by-step protons motion through membrane protein channels. // The 9th International Conference on System Biology, 2008, pp. 160.
-
Boronovsky, S.E. and Nartsissov, Ya.R.
Application of mathematical modeling of ions motion near the charged membrane surface as a tool for description oа single ion channel currents. // International Study Group for Systems Biology: Will bottom up meet top-down?, 2008, pp. 25-30.
-
Mashkovtseva, E.V., Boronovsky, S.E. and Nartsissov, Ya.R.
Pulsing charge model of the proton movement through a membrane protein channel of ATP synthase. // International Study Group for Systems Biology: Will bottom up meet top-down?, 2008, pp. 15-20.
-
Boronovsky, S.E. and Nartsissov, Ya.R.
Electrostatic model of glycine receptor ion channel. // Scientific session MEPHI-2006, 2006, 5, pp. 158-159.
-
Boronovsky, S.E., Seraya, I.P. and Nartsissov, Ya.R.
Brownian dynamic model of the glycine receptor chloride channel: effect of the position of charged amino acids on ion membrane currents. // IEE Proc.-Syst. Biol., 2006, 153(5), pp. 394-397.